Ecologia de Sphingomonas spp. em diferentes compartimentos da planta de Saccharum spp.

Resumo

Como alternativa ao uso agrícola de insumos químicos nitrogenados, pesquisas acerca da fixação biológica de nitrogênio ganham força uma vez que a substituição de uma prática pela outra seja benéfica tanto por seu baixo custo quanto pela sustentabilidade. Bactérias diazotróficas do gênero Sphingomonas, como organismos amplamente distribuídos que são, vem demonstrando grande capacidade de aplicação nos sistemas de produção agropecuários. Estudos de caracterização da microbiota endofítica da cana-de-açúcar através de sequenciamento de amplicon do gene para 16S rRNA têm apontado predominância de bactérias do gênero Sphingomonas no nicho da endosfera vegetal. O presente trabalho visou estudar a ecologia do gênero supracitado buscando compreender melhor sua presença e distribuição a partir de técnicas complementares de sequenciamento de amplicon de 16S rRNA, hibridização in situ fluorescente (“FISH”) e análises de qPCR ou PCR em tempo real. Estudos preliminares verificaram a estringência e especificidade das sondas a serem aplicadas nos testes “FISH” e, subsequentemente, iniciou-se análises em diversos compartimentos da planta que apontaram a presença do gênero levando a crer então uma colonização endofítica ampla, em especial nas regiões entre células mas não se limitando apenas a estas.