Prospecção de genótipos de Brachiaria para conhecimento da comunidade bacteriana associada às suas raízes.

Resumo

A pecuária extensiva é a forma de criação de bovinos predominante no Brasil, sendo as pastagens sua principal fonte de alimentação. Com o aumento e a valorização de produtos de origem animal como a carne e o leite, ocorreu uma expansão das pastagens brasileiras nas últimas décadas. Entre as gramíneas forrageiras identificadas em território nacional, encontram-se 16 espécies do gênero Brachiaria. Dentre essas, destacam-se, na região Amazônica, a Brachiaria humidicola, na região central a Brachiaria decumbens e nas regiões litorâneas e de solos úmidos a Brachiaria purpurascens. Todavia, a maior parte dessas pastagens encontra-se degradada ou em algum estágio de degradação, devido a fatores abióticos como, a baixa fertilidade do solo ou falta de chuvas; bióticos, como doenças e pragas; ou ainda as inadequadas práticas de manejo e pastejo. Assim, estratégias para conservação, manejo e aumento da produtividade das pastagens são, paulatinamente, necessárias no Brasil. Na tomada de decisão dessas estratégias, os microrganismos devem ser considerados por causa de seu importante papel no aumento de fertilidade dos solos e reciclagem de nutrientes, como a conversão e fixação do nitrogênio atmosférico em compostos nitrogenados. Desta forma, este trabalho visa fornecer dados sobre a diversidade molecular de bactérias associadas à rizosfera de gramíneas do gênero Brachiaria, por métodos independentes de cultivo, para um posterior cultivo e estudo mais aprofundado dessa comunidade. Para tal analise, foram utilizadas 11 amostras de quatro diferentes genótipos de Brachiaria: B. brizantha, B.decumbens, B. humidicula e B. ruzizienses, provenientes de pastos e do banco de germoplasma (BAG) da Embrapa Gado de Corte em Campo Grande, MS. Destas amostras, foi extraído o DNA diretamente do solo rizosférico, pelo uso de um kit comercial adequado. Posteriormente, foram realizadas reações de PCR para a amplificação parcial do gene 16S rDNA, com a utilização dos iniciadores 27F e 1492R, seguidos da amplificação com os iniciadores F986CG e R1401, em triplicatas. O produto de PCR foi submetido à eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE) e com o auxílio do software Bionumerics, foi montado um dendrograma do gel. De acordo com a análise dos perfis gerados no dendrograma houve coerência entre a maioria das triplicatas e foi possível observar um grande número de bandas, incitando uma alta diversidade entre as amostras. Não foi encontrada nenhuma correlação dos perfis com a origem da amostra (BAG e pastejo). Foi possível detectarmos quais amostras possuíam maior diversidade. Estas foram então selecionadas para uma próxima etapa de identificação dos grupos bacterianos predominantes na comunidade associada às raízes.